Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Trim29Q8R2Q0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Trim29Q8R2Q0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Trim29Q8R2Q0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Trim29Q8R2Q0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Trim29Q8R2Q0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Trim29Q8R2Q0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Trim29Q8R2Q0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim29Q8R2Q0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Trim29Q8R2Q0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Trim29Q8R2Q0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim29Q8R2Q0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,3 ms