Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs8Q8K3J1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs8Q8K3J1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs8Q8K3J1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs8Q8K3J1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms