Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acvr1cQ8K348 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acvr1cQ8K348 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acvr1cQ8K348 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acvr1cQ8K348 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acvr1cQ8K348 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Acvr1cQ8K348 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acvr1cQ8K348 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acvr1cQ8K348 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1cQ8K348 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acvr1cQ8K348 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acvr1cQ8K348 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acvr1cQ8K348 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acvr1cQ8K348 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms