Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud6bQ8K2H2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud6bQ8K2H2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud6bQ8K2H2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otud6bQ8K2H2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms