Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1K9

Hinfp, Histone H4 transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HinfpQ8K1K9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HinfpQ8K1K9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HinfpQ8K1K9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HinfpQ8K1K9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HinfpQ8K1K9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms