Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8K039 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8K039 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8K039 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8K039 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8K039 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8K039 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8K039 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8K039 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8K039 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8K039 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8K039 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8K039 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8K039 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8K039 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8K039 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8K039 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8K039 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8K039 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8K039 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8K039 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8K039 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8K039 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8K039 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8K039 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8K039 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8K039 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8K039 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8K039 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8K039 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8K039 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8K039 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8K039 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8K039 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8K039 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8K039 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8K039 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8K039 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8K039 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8K039 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8K039 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8K039 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q8K039 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8K039 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8K039 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8K039 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8K039 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8K039 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8K039 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8K039 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8K039 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8K039 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8K039 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8K039 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms