Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2-Q4Q8HWB2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
H2-Q4Q8HWB2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2-Q4Q8HWB2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2-Q4Q8HWB2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2-Q4Q8HWB2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-Q4Q8HWB2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-Q4Q8HWB2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
H2-Q4Q8HWB2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-Q4Q8HWB2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms