Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf628Q8CJ78 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf628Q8CJ78 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf628Q8CJ78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf628Q8CJ78 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms