Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TwnkQ8CIW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TwnkQ8CIW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TwnkQ8CIW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms