Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGB3

Uaca, Uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats, mousemouse

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UacaQ8CGB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,96■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
UacaQ8CGB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33,92■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
UacaQ8CGB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
UacaQ8CGB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33,81■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33,81■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33,79■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33,79■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
UacaQ8CGB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33,76■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33,75■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33,74■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33,7■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
UacaQ8CGB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
UacaQ8CGB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,2 ms