Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc3Q8CFZ4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc3Q8CFZ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc3Q8CFZ4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc3Q8CFZ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms