Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Setd1bQ8CFT2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Setd1bQ8CFT2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setd1bQ8CFT2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Setd1bQ8CFT2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Setd1bQ8CFT2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setd1bQ8CFT2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setd1bQ8CFT2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setd1bQ8CFT2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Setd1bQ8CFT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setd1bQ8CFT2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms