Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef8Q8CE24 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef8Q8CE24 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef8Q8CE24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms