Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc38Q8CDN8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc38Q8CDN8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc38Q8CDN8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms