Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Riox2Q8CD15 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Riox2Q8CD15 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Riox2Q8CD15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Riox2Q8CD15 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms