Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf31Q8CCF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf31Q8CCF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf31Q8CCF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms