Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo48Q8CAT8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo48Q8CAT8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo48Q8CAT8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo48Q8CAT8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms