Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8C3W1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8C3W1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8C3W1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8C3W1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q8C3W1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8C3W1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q8C3W1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8C3W1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8C3W1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8C3W1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C3W1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C3W1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C3W1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C3W1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C3W1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms