Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TiparpQ8C1B2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TiparpQ8C1B2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TiparpQ8C1B2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms