Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc9b1Q8C0X2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc9b1Q8C0X2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9b1Q8C0X2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b1Q8C0X2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b1Q8C0X2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9b1Q8C0X2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms