Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg16l1Q8C0J2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg16l1Q8C0J2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms