Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlrc2Q8BZW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc2Q8BZW8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc2Q8BZW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlrc2Q8BZW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc2Q8BZW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms