Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NkrfQ8BY02 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NkrfQ8BY02 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NkrfQ8BY02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NkrfQ8BY02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NkrfQ8BY02 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms