Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjd4Q8BSD4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gjd4Q8BSD4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjd4Q8BSD4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjd4Q8BSD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjd4Q8BSD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms