Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm10600Q8BQ57 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm10600Q8BQ57 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm10600Q8BQ57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms