Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfr1Q8BP27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfr1Q8BP27 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfr1Q8BP27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfr1Q8BP27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfr1Q8BP27 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms