Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hirip3Q8BLH7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hirip3Q8BLH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Hirip3Q8BLH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hirip3Q8BLH7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hirip3Q8BLH7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms