Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpa1Q8BLA8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpa1Q8BLA8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpa1Q8BLA8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpa1Q8BLA8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpa1Q8BLA8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpa1Q8BLA8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpa1Q8BLA8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms