Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chtf18Q8BIW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Chtf18Q8BIW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chtf18Q8BIW9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chtf18Q8BIW9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chtf18Q8BIW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chtf18Q8BIW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chtf18Q8BIW9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms