Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy1Q8BIJ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy1Q8BIJ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy1Q8BIJ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy1Q8BIJ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy1Q8BIJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy1Q8BIJ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms