Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Frmd3Q8BHD4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmd3Q8BHD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmd3Q8BHD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms