Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab1Q8BG18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Necab1Q8BG18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab1Q8BG18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab1Q8BG18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms