Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Liat1Q810M6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Liat1Q810M6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Liat1Q810M6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Liat1Q810M6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Liat1Q810M6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms