Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IfneQ80ZF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IfneQ80ZF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IfneQ80ZF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms