Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2bQ80XK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg2bQ80XK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg2bQ80XK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms