Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CyldQ80TQ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CyldQ80TQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CyldQ80TQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CyldQ80TQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms