Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf516Q7TSH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf516Q7TSH3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf516Q7TSH3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf516Q7TSH3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms