Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2aQ7TMM9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2aQ7TMM9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb2aQ7TMM9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb2aQ7TMM9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms