Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim12Q78RX3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim12Q78RX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim12Q78RX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms