Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
March6Q6ZQ89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
March6Q6ZQ89 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
March6Q6ZQ89 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms