Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Larp1Q6ZQ58 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Larp1Q6ZQ58 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Larp1Q6ZQ58 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Larp1Q6ZQ58 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Larp1Q6ZQ58 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms