Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy1Q6ZQ11 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chsy1Q6ZQ11 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chsy1Q6ZQ11 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chsy1Q6ZQ11 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms