Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r4Q6XJV4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r4Q6XJV4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r4Q6XJV4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r4Q6XJV4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r4Q6XJV4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms