Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssx9Q6XAS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ssx9Q6XAS3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssx9Q6XAS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssx9Q6XAS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms