Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M2Q6W9L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M2Q6W9L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M2Q6W9L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M2Q6W9L1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M2Q6W9L1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms