Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms