Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJN8

Dalrd3, DALR anticodon-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dalrd3Q6PJN8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dalrd3Q6PJN8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms