Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sort1Q6PHU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sort1Q6PHU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sort1Q6PHU5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sort1Q6PHU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sort1Q6PHU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sort1Q6PHU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sort1Q6PHU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sort1Q6PHU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms