Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc85bQ6PDY0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc85bQ6PDY0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85bQ6PDY0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms