Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDH0

Phldb1, Pleckstrin homology-like domain family B member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb1Q6PDH0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Phldb1Q6PDH0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Phldb1Q6PDH0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Phldb1Q6PDH0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Phldb1Q6PDH0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Phldb1Q6PDH0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Phldb1Q6PDH0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Phldb1Q6PDH0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Phldb1Q6PDH0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Phldb1Q6PDH0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Phldb1Q6PDH0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms